Nghiên cứu trình tự đoạn DNA chỉ thị trên gen ribosome 18s của một số loài hải miên (Porifera: Demospongiae) tại khu bảo tồn biển đảo Cồn Cỏ, tỉnh Quảng Trị [Molecular markers based on 18s ribosome gene fragments of sponges (Porifera: Demospongiae) collected from Con Co island, Quang Tri province].

Abstract

Rất ít công trình nghiên cứu về hải miên ở vùng biển Việt Nam liên quan tới thành phần loài, phân bố và tiềm năng sử dụng, đặc biệt, chưa có nghiên cứu nào ở mức độ sinh học phân tử. Các chỉ thị phân tử như gen ribosome 18S và 28S đã được lựa chọn để phân tích sự phát sinh chủng loại, phân loại và đa dạng sinh học của hải miên. Trong nghiên cứu này, đoạn DNA kích thước 559-561 bp trên gen ribosome 18S được phân lập từ 6 mẫu hải miên Biemna variantia, Niphates sp., Erylus sp., Mycale laevis, Dictyonella pelligera và Hyrtios erectus thu thập tại khu bảo tồn biển Đảo Cồn Cỏ. Kết quả phân tích trình tự nucleotide của các đoạn rDNA 18S cho thấy 6 mẫu hải miên có độ tương đồng từ 88,2-96,8% và từ 99,3-100% giữa mẫu hải miên với trình tự thuộc loài tương ứng đã đăng ký trên Ngân hàng Gen quốc tế, đồng thời thể hiện sự đa hình nucleotide giữa các loài nghiên cứu với 96 điểm sai khác.